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预先生学生融合了矩阵和医学

戈登烨

加州大学圣地亚哥的第二年前医学院戈登叶。YE利用计算技术在研究期间有助于更好地了解医学和生物学。

20世纪历史的Gordon Ye是加州大学圣地亚哥大学的第二年中学生,专注于计算机科学和生物医学计算;然而,最后一部分并不是他认为他会追求职业生涯。

“当我年轻时,我对计算机科学和技术感兴趣。通过我的第一笔记本电脑,我刷掉了硬盘,对我来说,在外面的情况下,如何如此简单,无缝的东西令人着迷;这是混乱和命令的并置,“你说。“每个组成部分都有一个目的,有一个特定的理由的特定地点。”

直到他高中的高中高中才申请他的魅力与计算机到医学,并意识到这两者如何不那么不同。

“人类和计算机有关,”叶说。“我们的身体内部的一切,在皮肤下面,就像计算机的组件一样;然而,人类有独特的能力 - 与机器不同,可以治愈自己。计算机将始终需要某种干预来解决故障。“

现在,你们对使用计算机有兴趣帮助身体愈合,而当它不能单独做。

在大学的第一年,YE联系了Sidney Zisook博士,UC San Diego的UC San Diego的Facectry Residency培训计划的精神病学培训计划部的杰出教授和朱迪戴维森。

“我想使用计算技术来更好地了解药物和生物学,因为它可以提供比与每个人一对一的一个更好的影响,”你说。“我向Zisook博士和戴维森博士伸出援手,因为我想帮助他们在护士和医生的抑郁和自杀预防研究。”

词云。

来自护士自杀案分析的词云。这些世界云描绘了死亡调查叙事中确定的自然语言处理分析的六个“主题”或类别。

作为他工作的一部分,Gordon将自然语言处理(NLP)应用于研究团队的数据集,包括关于患者的定性信息,包括生活方式选择,家庭生活和工作。NLP是一个人工智能的子场,可以通过能够处理人类语言的计算机并提供语言模型以找到模式。

“戈登改变了通常被忽视的定性信息,因为难以组织和分析,”Zisook说。“在我们研究医生的自杀风险因素的研究中,戈登能够确认成果,即女性医生比其他非医生女性更高的自杀风险,并且额外的风险部分与工作压力和心理健康问题有关。在没有戈登的帮助下,我们可能没有发现这么容易的信息。“

Zisook补充说,通过提供更具支持性的工作环境并使精神保健更加可用的精神医疗保健可以走向防止未来的自杀,以便参加这种知名的风险。

NLP技术YE通过利用频繁出现的单词或短语来使用工作,例如“萧条的历史”,“家庭”,“”工作“,”尝试“和”酒精“,”酗酒“,以发现大量死亡中的隐藏主题或主题调查叙述。从那里,研究人员浏览了主题,看看它们是否也从临床角度造成了意义,然后根据数据开发假设。

“我们使用NLP和彻底的手动审查过程来确定发现的内容,如果它确认我们的研究或揭示我们应该进一步调查的事情,”叶。“对于精神病学研究,重点是预防自杀,这尤其重要,因为每个人的案例都不同。每个人都有独特的生活经历,这是这些生活经历与我们的生物学相结合,这些生物能够有助于提高风险甚至保护我们发展它们。“

据戈登,精神病和精神健康研究的重点是遗传和基因组学是一个不完整的画面,因为它没有考虑个人的生命;他们的经历和压力源。另一方面,研究完全专注于生活经验,忽略生物学也是片面的。戈登认为每个人都互相补充,看看两者都对于精神病学中的未来药物来说是必不可少的。

“我想将来自我们基因的一切结合在我们的情绪中,以更好地了解发生的事情,”叶说。“如果你不看这张整体画面,它是不完整的并且导致治疗或药物和程序,可能不如每个人有效或适用。”

自从他与Zisook和Davidson一起工作以来,YE已经继续帮助采用统计和自然语言处理技术的其他三项出版的研究研究。2021年2月,YE是本文的第一个作者“美国自杀的医生死亡:2012-2016,”发表在精神病学杂志

“有一天,我从学生中拨打了一个电话。他说,我的名字是戈登叶,我对你的自杀预防工作很感兴趣,我想为你工作,“戴维森说。“从一天开始,他只是吞噬了这项工作。在他的帮助下,我们能够从医学审查员和警察报告数据中采取定性段落,以前从未分析过,以支持我们的研究。

“我惊讶于他作为一名第一年的学生接近这些数据集的天生能力,他们可能会崩溃正常电脑。我迫不及待地想看看他将来会做些什么。我相信戈登将改变医学领域。“

叶仍有几年,然后他将从UC圣地亚哥毕业。之后,他计划追求联合M.D./ph.d。学位和工作在生物医学信息学与精神病学中作为教授或研究人员的交汇处。

地图描绘了从自然语言处理分析中识别的六个主题。

描绘了从自然语言处理分析中识别的六个主题的地图。此地图可帮助团队视觉上查看主题的不同程度如何,并探索每个唯一的单词或短语。

“我希望参与具有社会福利的研究,”他说。“这不仅仅是关于训练在紧密控制的实验室设置中的高性能机器学习模型。我希望以一种帮助现实世界的方式使用数据。

“现在,我们的科学界和一般人口之间存在脱节;科学在某种程度上已经无法进入,我希望帮助桥梁弥补,以确保科学和医学用于服务所有人,从未以一种强化系统健康不公平的方式提供服务。“