医学预科学生融合矩阵和医学

Gordon Ye，加州大学圣地亚哥分校医学预科二年级学生。叶利用计算技术在研究过程中提供帮助，目的是更好地理解医学和生物学。

19岁的Gordon Ye是加州大学圣地亚哥分校医学预科二年级的学生，主要学习计算机科学和生物医学计算;然而，这最后一部分并不是他想要追求的职业。

“我年轻的时候对计算机科学和技术最感兴趣。在我的第一台笔记本电脑上，我换掉了硬盘驱动器，我很着迷于一个外观如此简单无缝的东西，它的内部却如此复杂;这是一种混乱和秩序的并置，”叶说。“每个部件都有一个目的，每个部件都出于特定的原因出现在特定的地方。”

直到高三，叶诚才将自己对计算机的迷恋运用到医学上，并意识到这两者并没有太大区别。

“人类和电脑是有联系的，”叶说。“我们身体里的所有东西，在皮肤下面，都是有目的的，就像电脑的组件一样;然而，与机器不同，人类有一种独特的能力——自愈。计算机总是需要某种干预来解决故障。”

现在，叶教授对用电脑帮助身体治愈自己无法治愈的疾病很感兴趣。

在大学一年级时，叶博士联系了加州大学圣地亚哥分校精神病学特聘教授、精神病学住院医师培训项目主任Sidney Zisook博士，以及加州大学圣地亚哥分校的研究科学家Judy Davidson。

叶说:“我想用计算技术来更好地理解医学和生物学，因为它可以提供比一对一工作更大的意义。”“我联系了Zisook博士和Davidson博士，因为我想帮助他们研究护士和医生的抑郁症和自杀预防。”

来自护士自杀案例分析的词汇云。这些世界云描述了自然语言处理分析在死亡调查叙事中确定的六个“主题”或类别。

作为工作的一部分，戈登将自然语言处理(NLP)应用于研究团队的数据集，其中包括患者的定性信息，包括生活方式的选择、家庭生活和工作。NLP是人工智能的一个分支领域，它使计算机具有处理人类语言的能力，并提供语言模型以发现模式。

Zisook说:“戈登转化了通常被忽视的定性信息，因为它很难组织和分析。”“在我们对医生自杀风险因素的研究中，戈登证实了一些发现，女医生比其他非医生的女性自杀风险更高，而且这种额外的风险部分与工作压力和心理健康问题有关。如果没有戈登的帮助，我们可能不会这么容易找到这些信息。”

Zisook补充说，通过提供更支持性的工作环境和更容易获得心理健康护理来关注这些已知的风险，可以在很大程度上防止未来的自杀。

叶通过利用频繁出现的单词或短语，如“抑郁症史”、“家庭”、“工作”、“尝试”和“酒精”，在大量死亡调查叙事中发现隐藏的主题或主题。从那里，研究人员查看这些主题，看看它们是否从临床的角度来看也有意义，然后根据数据提出假设。

“我们使用自然语言处理和一个彻底的人工审查过程来确定发现了什么，如果它证实了我们的研究，或者揭示了我们应该进一步研究的事情，”叶说。“对于专注于自杀预防的精神病学研究来说，这一点尤其重要，因为每个人的情况都不同。每个人都有独特的生活经历，正是这些生活经历与我们的生物学特性相结合，才会增加风险，甚至保护我们不患上风险。”

根据戈登的说法，专注于遗传学和基因组学的精神病学和精神健康研究是一个不完整的图景，因为它没有考虑到个人的生活;他们的经历和压力源。另一方面，只关注生活经验而忽视生物学的研究也是片面的。戈登认为，两者都是相互补充的，对精神病学精准医疗的未来至关重要。

叶说:“我想把从基因到情感的一切都结合起来，以便更好地理解发生了什么。”“如果你不考虑整个情况，它是不完整的，会导致治疗、药物和程序可能不那么有效或适用于每个人。”

自从他与Zisook和Davidson合作以来，Ye继续帮助其他三个利用统计和自然语言处理技术发表的研究。2021年2月，叶是《美国医生自杀死亡:2012-2016》这篇论文的第一作者，发表在《美国医学杂志》上精神病学研究杂志．

“有一天，我突然接到一个学生的电话。他说我叫Gordon Ye，我对你在预防自杀方面的工作很感兴趣，我愿意为你工作。”“从第一天起，他就如饥似渴地工作。在他的帮助下，我们能够从法医和警方报告中获得定性的段落——这些数据以前从未被分析过——来支持我们的研究。

“我惊讶于他作为一年级学生所拥有的处理这些数据集的天赋，这些数据集如此之大，以至于可以使一台普通计算机崩溃。我迫不及待地想看他将来会做什么。我相信戈登会改变医学领域。”

叶还需要几年时间才能从加州大学圣地亚哥分校毕业。之后，他计划攻读联合医学博士和博士学位。生物医学信息学和精神病学交叉学科的教授或研究员学位和工作。

描绘从自然语言处理分析中确定的六个主题的地图。这个地图可以帮助团队直观地看到主题的不同之处，并探索每个主题特有的单词或短语。

“我希望参与对社会有益的研究，”他说。“这不仅仅是在严格控制的实验室环境中训练高性能的机器学习模型。我想用数据来帮助现实世界中的人们。

“现在，我们的科学界和普通大众之间存在脱节;在某些方面，科学已经变得遥不可及，我想帮助弥合这一差距，确保科学和医学被用来服务于所有人，而不是以一种加剧系统性卫生不平等的方式。”