在医院表面检测到SARS-CoV-2，但可能不具有传染性

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通过观察2020年初世界各地发生的事情，加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员知道，他们的地区可能很快就会出现一波COVID-19患者，这种感染是由冠状病毒SARS-CoV-2引起的。他们想知道病毒是如何在表面上存活的，尤其是在医院里，而且他们知道，如果他们想捕捉到“之前”情况的快照，在感染患者入院之前，他们只有很小的时间窗口可以开始。

在一个周日的深夜接到一通电话后，一个小组第二天聚集在医院的大厅，准备进行擦拭。

在由此产生的研究中，描述了2021年6月8日的微生物组研究人员在入住前、期间和之后擦拭了病房表面，并随着时间的推移反复收集COVID-19患者及其医护人员的皮肤、鼻子和粪便样本。总的来说，他们在两个月内对972个医院相关样本进行了SARS-CoV-2的检测。

加州大学圣地亚哥分校医学院和斯克里普斯海洋研究所的助理项目科学家、联合资深作者萨拉·阿拉德博士说:“尽管感觉我们已经与这种病毒共存了很长一段时间，但对SARS-CoV-2与其他微生物之间相互作用的研究仍然是新的，我们仍然有很多问题。”“我们对病毒如何与环境相互作用了解得越多，我们就越能理解它是如何传播的，以及我们如何才能最好地阻断传播，预防和治疗这种疾病。”

合著者Daniel Sweeney医学博士指出，他在穿着个人防护装备(PPE)的情况下，在整个医院收集了样本。

他们的发现是:这种病毒，或者至少是它的基因特征非常丰富。研究小组在COVID-19患者床边的地板(39%)、病房外的地板(29%)和病房内的表面(16%)检测到了病毒。SARS-CoV-2的检测往往在患者出现症状后的前五天内最高。

研究人员很快指出，仅仅因为他们可以在表面上检测到病毒独特的遗传特征，并不意味着这种病毒能够感染人类。自他们开始这项研究以来，已有充分的证据表明，SARS-CoV-2主要通过密切的人际互动传播，而表面传播可能非常罕见。更重要的是，研究中积极照顾患者的医护人员都没有病毒检测呈阳性。这项研究集中在一家医院，但研究人员预计，他们会在任何一家治疗COVID-19患者的医院发现类似的结果。

“这在很多层面上都很重要，”联合资深作者Daniel Sweeney博士说，他是加州大学圣地亚哥分校健康中心的重症监护和传染病医生。“我们需要知道我们的个人防护装备PPE是否足够，幸运的是，我们现在知道口罩、手套、防护服和面罩等确实有效。这场大流行是一场全球灾难，但如果我们的医护人员被感染，情况可能会更糟，尤其是在我们不知道原因的情况下。”

病毒通常不会单独活动。无论是在人身上还是在表面，它们都是被称为微生物群落的复杂群落的一部分，其中可能包括各种其他病毒、细菌和其他微生物。在寻找冠状病毒的过程中，研究小组还发现了其他东西:该属的一种特殊类型的细菌罗思氏菌属通常与SARS-CoV-2一起被发现，无论收集地点如何。换句话说，罗斯亚的存在有力地预测了他们也将在同一样本中检测到SARS-CoV-2。

研究小组的一名成员擦拭了医院的地板，以帮助确定SARS-CoV-2在哪里。

“为什么会有这种关系?阿拉德问。“是细菌帮助病毒存活，还是相反?”或者只是这些细菌与潜在的医疗条件有关，这些条件首先使患者患严重COVID-19的风险更高?这是未来研究的一个领域。”

这项研究从一开始就是一个挑战，随着医院的重症监护室开始接收更多的COVID-19患者，这项研究变得更加困难。该团队特别设计了他们的方法，以利用现有资源，不给临床护理和检测所需的供应链带来压力。在另一项努力中，该团队的一些成员和他们的同事开发的替代棉签为了研究目的。他们尽可能快速有效地收集样本，以最大限度地减少对患者护理的干扰。这些样本在酒精中被运回实验室，保存病毒以供分析，但不让研究人员接触活性生物体。

“在过去的几个月里，很多人做了大量的基础和临床研究，我们做得很好，”Sweeney说。“我们增加了基础设施。我们获得了经验。我希望无论接下来发生什么，同样的专注、动力和精神都能继续下去。”

这项研究的共同作者包括:Clarisse Marotz, Pedro Belda-Ferre, Farhana Ali, Promi Das, Shi Huang, Kalen Cantrell, Lingjing Jiang, Cameron Martino, Rachel E. Diner, Gibraan Rahman, Daniel McDonald, George Armstrong, Sho Kodera, Sonya Donato, Gertrude ecklumensah, Neil Gottel, Mariana C . Salas Garcia, Leslie Y. Chiang, Rodolfo A. Salido, Justin P. Shaffer, MacKenzie Bryant, Karenina Sanders, Greg Humphrey, Gail Ackermann, Laxmi Parida, Yoshiki Vázquez-Baeza, Francesca J. Torriani, Rob Knight, Jack Gilbert, UC San Diego;Niina Haiminen, IBM, T.J. Watson研究中心;克里斯汀·l·贝克，金镐哲，IBM阿尔马登研究院;以及IBM英国研究院的安娜·保拉·卡里里。

这项研究的资金部分来自美国国立卫生研究院(资助GM068524, 1DP1AT010885和1P30DK120515)，美国国家科学基金会(资助P2011025)， IBM人工智能研究中心和加州大学圣地亚哥分校微生物组创新中心。